3分でわかる技術の超キホン 核酸とは③(測定・分析・診断編)
別コラム(核酸とは②)で食品(飼料を含む)への利用について述べましたので、今回は核酸(DNA等)の測定・分析・診断について簡単にまとめてみましょう。
目次
1.核酸の主な測定・分析技術
(1)PCR法
PCR法(ポリメラーゼ連鎖反応/Polymerase Chain Reaction)は、1985年にマリス(Mullis)によって考案されたDNAの増幅法です。
耐熱性DNAポリメラーゼ(Taq ポリメラーゼ)が1988年に見出されたことによって実用化されました。
DNA鎖の熱変性(2本鎖DNAの一本鎖への解離)、プライマーのアニーリング(プライマーがDNAと結合すること)、耐熱性DNAポリメラーゼによる相補鎖の合成を繰り返し行うことにより、DNAのある一部分だけを選択的に増幅させることができる手法です。
PCRで増幅したDNAは、電気泳動により増幅サイズに応じて分離した後、エチジウムブロマイド等で染色してバンドとして可視化します。
この方法によれば、プライマーを設計するだけでよく、クローニングを必要しないため、分子生物学、基礎医学、遺伝学、育種学、薬学の他に、臨床診断、遺伝子診断、犯罪捜査、DNA鑑定、微生物検査、考古学などの幅広い分野に利用されています。この方法を用いると、DNAを数時間で100万倍に増幅できます。
[※関連コラム:「PCR検査」とは?基本原理・種類・特徴など早わかり解説 はこちら]
(2)RT-PCR法
RNAをPCR増幅する手法で、基本的な原理はPCR法と同じです。RNAはDNA ポリメラーゼの鋳型とはならないため、PCRで増幅するには、まずRNAをDNAに変換する必要があります。
RNAからDNAへの変換を逆転写(Reverse Transcription;RT)と呼びます。
逆転写酵素によりRNAから変換されたDNAはcDNA(cはcomplementary、相補的の意味)と呼ばれ、PCRの鋳型となります。
(3)リアルタイムPCR法
PCR増幅産物の増加をリアルタイムでモニタリングし、解析する方法です。
従来のPCR法に比べて、正確な定量が可能です。
リアルタイムPCRでは、PCR増幅産物を蛍光により検出します。
検出方法は、大きく分けてインターカレーターを用いる方法と蛍光標識プローブを用いる方法の2種類があります。
(4)ブロッティング(blotting)
(a) サザン(Southern)ブロッティング
標識したmRNAやcDNAでDNA断片を検出する方法です。
(b) ノザン(Northern)ブロッティング
標識したcDNAdでmRNAを検出する方法です。
(5)ハイブリダイゼーション(hybridization)
放射性標識したcDNAやmRNAと2本鎖を形成するかどうかを調べる方法です。
このような目的に使われる標識物をプローブ(probe)と呼びます。
2.核酸の測定・分析・診断技術に関する特許を調べてみる
核酸の測定・分析・診断技術に関する主なFIのみを用いて検索した結果は以下の通りです。
(2018年5月2日現在。J-PlatPatによる検索結果)
FI | ドット | 件数 | 説明 |
C12N15/00@F | 1 | 4,044件 | DNAチップ、マイクロアレイ |
C12Q1/68 | 1 | 14,773件 | 核酸を含むもの[3] |
C12Q1/68@A | 0 | 28,835件 | DNAプローブ,例.プローブを利用したスクリーニング,構造解析または診断/遺伝子断片の増幅をするためのプライマー、遺伝子増幅方法の改良法 |
C12Q1/68@Z | 0 | 2,930件 | その他,例.塩基配列決定,ATP測定による鮮度判定/プローブを用いない制限断片長による判別、検出用ラベルをつけた核酸誘導体。 |
G01N30/88@D | 2 | 382件 | 核酸/DNAやRNA、PNAなど、核酸類を測定する文献 |
G01N33/50@P | 0 | 3,041件 | 核酸/生物学的材料,例.血液,尿,の化学分析(G01N33/50)の下位 |
G01N33/53@M | 0 | 9,389件 | 核酸/免疫分析;生物学的特異的結合分析(G01N33/53の下位) |
G01N33/58@A | 0 | 1,237件 | 核酸に関するもの/標識物質を含むもの(G01N33/58・・・)の下位 |
なお、核酸の測定に直接関係すると思われるFI(DNAチップ、マイクロアレイを除く)を全て足して検索した結果は以下の通りです。
[C12Q1/68/FI+C12Q1/68@A/FI+C12Q1/68@Z/FI+G01N30/88@D/FI
+G01N33/50@P/FI+G01N33/53@M/FI+G01N33/58@A/FI]
⇒ ヒット件数 38,097件
なお、上記FIと核酸の分析やPCRに関連するキーワードを掛け合わせて検索した結果は以下の通りです。
[C12Q1/68/FI+C12Q1/68@A/FI+C12Q1/68@Z/FI+G01N30/88@D/FI
+G01N33/50@P/FI+G01N33/53@M/FI+G01N33/58@A/FI]
*核酸/CL+DNA/CL+RNA/CL+PCR/CL+ポリメラーゼ/CL]
⇒ ヒット件数31,273件
以上は件数の概要を見るための検索結果ですので、あくまでも参考としてご利用ください。
(日本アイアール株式会社 特許調査部 A・A)
関連コラム
- 3分でわかる技術の超キホン:核酸とは①(医薬編)はこちら
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