メタボローム解析技術の基礎と具体的なデータ解釈・設計方法【提携セミナー】

計測インフォマティクス

メタボローム解析技術の基礎と具体的なデータ解釈・設計方法【提携セミナー】

開催日時 未定
担当講師

杉本 昌弘 氏

開催場所 未定
定員 -
受講費 未定

☆高品質なデータを取得し、より良い実験研究につなげるためのコツとノウハウ!

☆本講座では、メタボローム測定技術や研究事例紹介に始まり、

MetaboAnalystを用いたデータ解析実演・具体的な留意事項等に至るまで!

☆はじめて学ぶ方にも理解しやすいよう、やさしく解説いたします!

 

メタボローム解析技術の

基礎と具体的なデータ解釈・設計方法

 

《具体的な成功例・失敗例から学ぶ研究のデザイン・

実際のデータ解析のデモとその解釈方法を紹介》

 

【提携セミナー】

主催:株式会社情報機構

 


 

メタボローム解析は複数の代謝物を同時に分析でき、多くの分野で利用されていますが、技術的な課題も多く、何でも測定できるわけではありません。各測定方法の特性やデータのクセを理解することで、わずかな工夫で高品質なデータを得ることが可能です。

 

本講座は初心者向けに、(1)実験計画の設計ポイント、(2)データ解釈のコツを実例とともに解説し、さらに、Web上のフリーツールを用いた解析手法をステップバイステップで紹介します。上級者が感覚的に使っているノウハウとコツを知って頂き、実際の解析に活用ください。

 

◆受講後、習得できること

  • メタボローム解析の基礎的な技術が理解でき、実験計画の設計ができるようになる
  • メタボロームを利用した論文の信頼性を読み取れるようになる
  • メタボローム分野で利用される標準的なデータ解析(Clustering, Heatmap, Volcano plot, PCA, PLS-DA, FDRによる擬陽性対策, ROC解析、Pathway解析、Enrichment解析、データのノーマライズ処理等)等をマウス数クリックだけで実施できるようにする。

 

◆講演中のキーワード

  • メタボローム
  • メタボロミクス
  • バイオマーカー
  • MetaboAnalyst
  • 多変量解析

 

担当講師

慶應義塾大学 先端生命科学研究所
政策・メディア研究科 教授
博士(学術、歯学)
杉本昌弘 氏

 

経歴
【学歴】
2000年 早稲田大学大学院 理工学研究科 機械工学専攻 工学修士 取得
2005年 慶應義塾大学大学院 政策・メディア研究科 博士(学術)取得
2013年 神奈川歯科大学大学院 博士(歯学)取得
【職歴】
2000年~2010年 三菱スペース・ソフトウェア株式会社
2010年 慶應義塾大学 政策・メディア研究科 特別研究講師
2011年4月~2013年3月 京都大学大学院 医学研究科 メディカルイノベーションセンター悪性制御研究所 特定講師
2017年 慶應義塾大学 政策・メディア研究科 特任教授
2017年~2022年 東京医科大学 医学総合研究所 教授
2023年 慶應義塾大学 政策・メディア研究科 教授

専門および得意な分野・研究
・メタボロミクス
・バイオインフォマティクス
・システムズ・バイオロジー

 

セミナープログラム(予定)

1. メタボロームの測定技術
1.1 分離装置+質量分析装置の原理は?
1.2 各装置をどのように使い分ければよいか?

 

2. メタボロームの研究例の紹介
2.1 設計・測定・データ解析・解釈が分かる一連の研究事例の紹介

 

3. メタボロームのデータに関する詳細
3.1 測定データの構造は?
3.2 データ処理の仕組みは?

 

4. MetaboAnalyst(Web上のフリーツール)を用いたデータ解析のデモと解釈方法の紹介
4.1 論文でよく見る図の意味は?
4.2 マウス数クリックでできる簡単データ解析の紹介
4.3 データの概要を俯瞰する:クラスタリングとヒートマップ
4.4 メタボローム独自の統計方法:論文投稿へのお作法
4.5 外れ値と想定していなかった群の探索するには?
4.6 多変量解析で設計した群をわけている物質を探すには?
4.7 代謝経路単位でデータを解釈するには?

 

5. 成功事例と失敗事例から学ぶ比較デザイン
5.1 論文の実例から、どのようにデータ解析を設計したか?
5.2 観測できた代謝物の変動は、本当に意味がある変動か?
5.3 データに記載されてきた物質名は正しいか?
5.4 多変量解析の結果は再現性が得られない?
5.5 同じサンプルを測定しているのに値が違う?
5.6 未知物質を解析するには?

 

6. おわりに

 

7. 質疑応答

 

公開セミナーの次回開催予定

開催日

未定

 

 

開催場所

未定

 

 

受講料

未定

 

 

*学校法人割引;学生、教員のご参加は受講料50%割引。

 

●録音・撮影行為は固くお断り致します。

 

オンライン配信のご案内

★ Zoomによるオンライン配信

については、こちらをご参照ください

 

備考

※配布資料等について

●配布資料はPDF等のデータで配布致します。ダウンロード方法等はメールでご案内致します。

  • 配布資料に関するご案内は、開催1週前~前日を目安にご連絡致します。
  • 準備の都合上、開催1営業日前の12:00までにお申し込みをお願い致します。
    (土、日、祝日は営業日としてカウント致しません。)
  • セミナー資料の再配布は対応できかねます。必ず期限内にダウンロードください。

 

●当日、可能な範囲でご質問にお答えします。(全ての質問にお答えできない可能性もございます。何卒ご了承ください。)
●本講座で使用する資料や配信動画は著作物であり、無断での録音・録画・複写・転載・配布・上映・販売などは禁止致します。

 

お申し込み方法

★下のセミナー参加申込ボタンより、必要事項をご記入の上お申し込みください。

★【オンラインセミナー(見逃し視聴なし)】、【オンラインセミナー(見逃し視聴あり)】のいずれかから、ご希望される受講形態をメッセージ欄に明記してください。

 

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