メタボローム解析の初めの一歩から、データを読み取るまでの実践的ノウハウの紹介【提携セミナー】

計測インフォマティクス

メタボローム解析の初めの一歩から、データを読み取るまでの実践的ノウハウの紹介【提携セミナー】

開催日時 2024/9/12(木) 13:00-17:00
担当講師

杉本 昌弘 氏

開催場所

Zoomによるオンラインセミナー

定員 -
受講費 【オンラインセミナー(見逃し視聴なし)】:41,800円(税込)
【オンラインセミナー(見逃し視聴あり)】:47,300円(税込)

☆本セミナーでは、以下のようなポイントを軸に解説いたします!
 1.メタボローム測定技術(分離・質量分析装置の各原理や使い分け等。)
 2.研究例の紹介(肝疾患・がん等のバイオマーカー探索。)
 3.メタボロームデータの詳細(データの構造や処理の基礎知識。)
 4.データ解析実演(FDR/PCA/PLS-DA/Pathway解析/Enrichment解析/ROC解析etc)
 5.具体的な設計方法(研究デザイン/データ評価/多変量解析/品質担保/機械学習etc)
☆お申込み後、事前リクエストも募っております。遠慮なくお申し付けください!

メタボローム解析の初めの一歩から、

データを読み取るまでの実践的ノウハウの紹介

 

《具体的な研究の設計方法とMetaboanalyst(フリーソフト)を用いたデータ解析の実演》

 

【提携セミナー】

主催:株式会社情報機構

 


 

メタボローム解析(代謝物を一斉分析)は、代謝の機能解明、疾患バイオマーカー探索、食品の品質向上など幅広く利用されてきている。しかし、実際には測定方法に様々な限界があり、データに独特のクセもあり、それなりの工夫やノウハウが必要となる。

この講座では、メタボロームを始める前の方や、少しやり始めた方を対象としている。メタボローム解析のユーザーの視点で、何を注意・意識して実験を設計すべきか、データをどのような視点で解釈すれば期待した解釈が得られるか、などの方法論と実例を紹介する。Web上のフリーツールを用いて多変量解析やPathway解析等、自ら実施できるようStep by Stepで紹介する。

 

◆受講後、習得できること

  • メタボローム解析の基礎的な技術が理解でき、実験計画の設計ができるようになる
  • メタボロームを利用した論文の信頼性を読み取れるようになる
  • メタボローム分野で利用される標準的なデータ解析(Clustering, Heatmap, Volcano plot, PCA, PLS-DA, FDRによる擬陽性対策, ROC解析、Pathway解析、Enrichment解析、データのノーマライズ処理等)等をマウス数クリックだけで実施できるようにする。

 

◆講演中のキーワード

  • メタボローム
  • メタボロミクス
  • バイオマーカー
  • MetaboAnalyst
  • 多変量解析

 

担当講師

慶應義塾大学 先端生命科学研究所
政策・メディア研究科
教授 博士(学術、歯学)
杉本昌弘 先生

 

■経歴

【学歴】

2000年 早稲田大学大学院 理工学研究科 機械工学専攻 工学修士取得

2005年 慶應義塾大学大学院 政策・メディア研究科 博士(学術)取得

2013年 神奈川歯科大学大学院 博士(歯学)取得

 

【職歴】

2000年~2010年 三菱スペース・ソフトウェア株式会社

2010年 慶應義塾大学 政策・メディア研究科 特別研究講師

2011年4月~2013年3月 京都大学大学院 医学研究科 メディカルイノベーションセンター悪性制御研究所 特定講師

2017年 慶應義塾大学 政策・メディア研究科 特任教授

2017年~2022年 東京医科大学 医学総合研究所 教授

2023年 慶應義塾大学 政策・メディア研究科 教授

 

■専門および得意な分野・研究

  • メタボロミクス
  • バイオインフォマティクス
  • システムズ・バイオロジー

 

■本テーマ関連学協会での活動

  • 日本オミックス医学会
  • Metabolomics Society
  • 日本バイオインフォマティクス学会
  • 日本分子生物学会
  • 歯科基礎医学会
  • 日本膵癌学会
  • 日本癌学会
  • 日本乳癌学会

 

セミナープログラム(予定)

1. メタボロームの測定技術

1.1 分離装置+質量分析装置の原理は?

1.2 各装置をどのように使い分ければよいか?

 

2. メタボロームの研究例の紹介

2.1 NASHなど肝疾患のマーカー探索(疾患部の代謝変化を血液中の代謝の変化でとらえる)

2.2 がんのマーカー探索(がんの組織部の代謝異常を尿中で検出する)

 

3. メタボロームのデータに関する詳細

3.1 データの構造(データをどのように見ればよいのか?)

3.2 データ処理の基礎(質量分析装置から定量値を得るまでの一連の処理)

 

4. MetaboAnalyst(Web上のフリーツール)を用いたデータ解析のデモ

4.1 論文でよく見る解析の図の意味を紹介

4.2 マウス数クリックでできる簡単データ解析

4.3 実は最も重要なデータのノーマライズ+クラスタリング+ヒートマップ

4.4 オミックスで当たり前に求められるP値の補正(FDR)

4.5 奥が深い主成分分析(PCA)

4.6 部分的最小二乗回帰(PLS-DA)(パワフルだけど慎重に使うべき多変量解析)

4.7 Pathway解析/Enrichment解析(Pathway単位でのデータ解析)

4.8 ROC解析

 

5. 何を具体的に気を付けた設計が必要か?

5.1 論文の実例から、どのようにデータ解析を設計したか(オプションによって解析結果は変わる)

5.2 メタボローム独自の研究デザイン設計(2群間の差は2群だけでは証明できない)

5.3 同定の問題点(どのような課題があり、どのような視点でデータを評価すべきか?)

5.4 多変量解析の誤用(一般化が全て。それだけなのに多くの論文が間違う)

5.5 長期的な測定での品質担保(メタボローム独自のサンプル劣化等の問題)

5.6 ノンターゲット解析(未知物質は使えるのか?)

5.7 機械学習を使った解析のノウハウ(楽観的な結果に陥らないノウハウは?)

 

6. おわりに

 

7. 質疑応答

 

公開セミナーの次回開催予定

開催日

2024年9月12日(水) 13:00-17:00

 

開催場所

Zoomによるオンラインセミナー

 

受講料

【オンラインセミナー(見逃し視聴なし)】:1名41,800円(税込(消費税10%)、資料付)
*1社2名以上同時申込の場合、1名につき30,800円

 

【オンラインセミナー(見逃し視聴あり)】:1名47,300円(税込(消費税10%)、資料付)
*1社2名以上同時申込の場合、1名につき36,300円

 

*学校法人割引;学生、教員のご参加は受講料50%割引。

 

●録音・撮影行為は固くお断り致します。

 

オンライン配信のご案内

★ Zoomによるオンライン配信

については、こちらをご参照ください

 

備考

※配布資料等について

●配布資料はPDF等のデータで配布致します。ダウンロード方法等はメールでご案内致します。
・配布資料に関するご案内は、開催1週前~前日を目安にご連絡致します。
・準備の都合上、開催1営業日前の12:00までにお申し込みをお願い致します。
(土、日、祝日は営業日としてカウント致しません。)
・セミナー資料の再配布は対応できかねます。必ず期限内にダウンロードください。

 

●当日、可能な範囲でご質問にお答えします。(全ての質問にお答えできない可能性もございます。何卒ご了承ください。)
●本講座で使用する資料や配信動画は著作物であり、無断での録音・録画・複写・転載・配布・上映・販売などは禁止致します。

 

お申し込み方法

★下のセミナー参加申込ボタンより、必要事項をご記入の上お申し込みください。

★【オンラインセミナー(見逃し視聴なし)】、【オンラインセミナー(見逃し視聴あり)】のいずれかから、ご希望される受講形態をメッセージ欄に明記してください。

 

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