質量分析・インフォマティクスの基礎知識から押さえるメタボロミクスデータ解析ハンズオンセミナー【提携セミナー】

質量分析・インフォマティクスの基礎知識から押さえるメタボロミクスデータ解析ハンズオンセミナー【提携セミナー】

このセミナーは終了しました。次回の開催は未定です。

おすすめのセミナー情報

開催日時 2024/2/19(月)13:00-17:00
担当講師

津川 裕司 氏

開催場所

Zoomによるオンラインセミナー

定員 -
受講費 41,800円

☆メタボロミクスデータを「出す側」「使う側」それぞれに必要なインフォマティクス基礎知識から解説!

☆講師PCで実際に解析の様子を示しながらわかりやすく。最新の研究トレンドと実践的な技術まで!

 

質量分析・インフォマティクスの基礎知識から押さえる

メタボロミクスデータ解析ハンズオンセミナー

 

【提携セミナー】

主催:株式会社情報機構

 


 

本講座では、メタボロミクス研究の現状とその課題について、特にデータ解析に焦点を当てて説明する。メタボロミクスは、生物の代謝産物を網羅的に分析することによって、生命現象の理解を深める分野である。しかし、膨大なデータの取得と解析には質量分析および関連するインフォマティクスツールの深い知識が必要となる。このセミナーでは、質量分析の基礎から始め、メタボロミクス研究におけるデータ解析の効果的なアプローチを、演者の研究背景を踏まえて解説する。これにより、メタボロミクスの研究における最新のトレンドと実践的な技術を学ぶことを目標にする。

 

◆受講後、習得できること

  • メタボロミクスの概要
  • メタボロミクスデータを「出す側」に必要なインフォマティクス基礎知識(データ処理・アノテーション)
  • メタボロミクスデータを「使う側」に必要なインフォマティクス基礎知識(多変量解析・パスウェイ解析)

 

◆講演中のキーワード

質量分析インフォマティクス、ケムインフォマティクス、
MS-DIAL、MS-FINDER、MetaboAnalyst

 

担当講師

東京農工大学 工学研究院 テニュアトラック准教授 津川裕司 先生

 

■経歴
2009年 大阪大学工学部応用自然科学科卒業
2011年 大阪大学大学院工学研究科生物資源工学専攻博士前期課程修了
2012年 大阪大学大学院工学研究科生物資源工学専攻博士後期課程修了
博士号取得年月日: 2012年9月30日(2023年4月1日時点、取得後12年)
取得機関:大阪大学大学院工学研究科・生命先端工学専攻
種類:博士(工学)

2012年 日本学術振興会特別研究員(DC2)
ガスクロマトグラフィー質量分析(GC-MS)を用いたメタボローム情報計測の技術開発に関する研究
2012年-2013年 理化学研究所植物科学研究センター 特別研究員
有田正規チームリーダー(本務・国立遺伝学研究所)の研究室でメタボローム情報科学に関する研究
2013年-2017年 理化学研究所環境資源科学研究センター 特別研究員
同研究室にて、代謝物の多様性を解き明かすケムインフォマティクスを用いた生命科学研究(UC Davis Oliver Fiehn教授の下に1年間留学)
2017年-2021年 理化学研究所環境資源科学研究センター 研究員
同研究所生命医科学研究センター 研究員兼務
有田誠チームリーダー(本務・慶應義塾大学薬学部)の研究室と兼務し、脂質の多様性とその生物学的意義解明に向けた研究に従事
2021年-現在 東京農工大学グローバルイノベーション研究院  テニュアトラック准教授
代謝物の多様性を捉えるための情報工学研究(道具作り)と、それを用いた生物学的重要性の理解へ向けたデータ駆動・ディスカバリー志向型のシステムバイオロジー研究を推進

■専門および得意な分野・研究
生物学・生化学・分析化学・オミクス科学・質量分析・
質量分析インフォマティクス・ケムインフォマティクス・バイオインフォマティクス

 

セミナープログラム(予定)

1.質量分析を用いたメタボロミクス概要

 

2.メタボロミクスのデータ解析に必要なインフォマティクス基礎知識
1) 質量分析インフォマティクス
a) 計測データの構造(各社生データ、共通フォーマットデータ)
b) データプロセッシング概要(ピークコール・アライメントなど)
c) アノテーション概要(スペクトルライブラリー検索など)
2) (メタボロミクスにおける)ケムインフォマティクス
a) 未知スペクトルのアノテーション概要
b) アダクトタイプの推定
c) 組成式の推定
d) 構造・オントロジーの推定
3) (メタボロミクスにおける)バイオインフォマティクス
a) バイオインフォマティクスの概要
b) 多変量解析の紹介(主成分分析)
c) 代謝パスウェイ解析
d) 統合オミクス解析

 

3.メタボロミクスのデータ解析のハンズオン
1) 質量分析インフォマティクス(MS-DIALの使い方)
2) ケムインフォマティクス(MS-FINDER・分子ネットワーク解析)
3) バイオインフォマティクス
a) VANTEDの紹介
b) WikiPathways+CytoScapeの紹介
c) MetaboAnalystの紹介

 

公開セミナーの次回開催予定

開催日

2024年2月19日(月) 13:00-17:00

 

開催場所

Zoomによるオンラインセミナー

 

受講料

1名41,800円(税込、資料付)
*1社2名以上同時申込の場合、1名につき30,800円

 

*学校法人割引;学生、教員のご参加は受講料50%割引。

 

●録音・録画行為は固くお断り致します。

 

オンライン配信のご案内

★ Zoomによるオンライン配信

については、こちらをご参照ください

 

備考

※配布資料等について

●配布資料はPDF等のデータで配布致します。ダウンロード方法等はメールでご案内致します。

  • 配布資料に関するご案内は、開催1週前~前日を目安にご連絡致します。
  • 準備の都合上、開催1営業日前の12:00までにお申し込みをお願い致します。
    (土、日、祝日は営業日としてカウント致しません。)
  • セミナー資料の再配布は対応できかねます。必ず期限内にダウンロードください。

 

●当日、可能な範囲でご質問にお答えします。(全ての質問にお答えできない可能性もございます。何卒ご了承ください。)
●本講座で使用する資料や配信動画は著作物であり、無断での録音・録画・複写・転載・配布・上映・販売などは禁止致します。

 

お申し込み方法

★下のセミナー参加申込ボタンより、必要事項をご記入の上お申し込みください。

 

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